Abstract
Common variations in the calpain 10 (CAPN10) gene variants UCSNP-43, UCSNP-19 and UCSNP-63, and the 112/121 diplotype, are associated with an increased risk of type 2 diabetes (T2DM) and T2DM-related traits.
The association of UCSNP-43, -19 and -63 CAPN10 SNPs with T2DM was assessed in 917 Tunisian T2DM patients and 748 ethnically matched non-diabetic controls.
CAPN10 genotyping was done by PCR-RFLP.
Significant differences in UCSNP-19 MAF, but not UCSNP-43 or -63, and genotype distribution were seen between patients and controls. Heterogeneity in UCSNP-19, but not UCSNP-43 and -63, genotype distribution was noted according to geographical origin. Obesity was associated with UCSNP-19, while raised fasting glucose was associated with UCSNP-63, and increased HDL was associated with UCSNP-43. Enrichment of homozygous UCSNP-19 2/2 was seen in overweight and obese compared with lean patients; logistic-regression analyses demonstrated a positive association of the 2/2 genotype with overweight [
P
=
0.003; OR (95% CI)
=
2.07 (1.28–3.33)] and obese [
P
=
0.021; OR (95% CI)
=
1.83 (1.10–3.07)] patients. Of the six
CAPN10 haplotypes identified, significant enrichment of only haplotype 111 was seen in T2DM patients [
Pc
=
0.034; OR (95% CI)
=
1.22 (1.06–1.41)], while the frequency of all identified
CAPN10 diplotypes, including the high-risk 112/121, was comparable between patients and controls.
While CAPN10 UCSNP-19 SNP and haplotype 111 contribute to the risk of T2DM in Tunisian subjects, no significant association between
CAPN10 diplotypes and T2DM was demonstrated.
Des variants communs du gène de la calpaine-10 (CAPN10), en particulier UCSNP-4, UCSNP-19 et UCSNP-63 et le diplotype à risque (combinaison haplotypique) (112/121) ont été associée à l’augmentation du risque du diabète de type 2 (DT2) et les traits associés.
L’association du DT2 et des SNPs UCSNP-43, UCSNP-19 et UCSNP-63 du gène CAPN10 a été étudiée chez 917 diabétiques tunisiens et 748 témoins non diabétiques de même origine. Le génotypage du gène
CAPN10 a été réalisé par PCR-RFLP.
Des différences significatives de la distribution génotypique du UCSNP-19, mais non d’UCSNP-43 et UCSNP-63 ont été observées entre les patients et les témoins. Une hétérogénéité de la distribution génotypique du UCSNP-19 mais non de celle d’UCSNP-43 et UCSNP-63 a été notée selon l’origine géographique. L’obésité était associée avec UCSNP-19, l’hyperglycémie à jeun avec UCSNP-63, alors que l’élévation du HDLc était en corrélation avec UCSNP-43. L’enrichissement d’UCSNP-19 en homozygote 2/2 a été observé chez les patients en surpoids et obèses comparés aux patients de poids normal. L’analyse par régression logistique a mis en évidence une corrélation positive entre le génotype 2/2 chez les patients en surpoids [
P
=
0,003; OR (95 % IC)
=
2,07 (1,28–3,33)] et obèses [
P
=
0,021; OR 1,83 (1,10–3,07)]. Parmi les six haplotypes de
CAPN10 identifiés, un enrichissement significatif pour le seul haplotype 111 a été observé chez les DT2 [
Pc
=
0,034; OR 1,22 (1,06–1,41)] alors que les fréquences de tous les diplotypes de CAPN10 identifiés, dont le diplotype à risque 112/121 étaient comparables entre les patients et les témoins.
Le variant commun UCSNP-19 SNP de CAPN10 et l’haplotype 111 contribuent au risque de DT2 chez les sujets tunisiens; aucune association significative n’a été mise en évidence entre les diplotypes de
CAPN10 et le DT2.